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（1）老库（窖)消毒
在新薯入库(窖)前，要对贮藏窖进行清扫，然后用百速烟剂或硫磺熏蒸消毒，也可以用来苏尔水喷洒窖的四周、库顶与地面。入库后用高锰酸钾和甲醛溶液熏蒸消毒，每120平方米用500克高锰酸钾、700毫升甲醛溶液，每月熏蒸1次，防止块茎腐烂和病害的蔓延。
(2)严把入库（窖）关
入库时严格剔除病薯、烂薯与受冻薯。另外，马铃薯收获后带有大量的田间热，应在库外预冷，防止库温升高。入库前要将马铃薯堆在暗处进行15～20天的预贮处理，要求温度12～20℃，湿度60%～70％，有利于擦伤的块茎更好愈合。
(3)控制贮量与堆高
在库内可堆放或筐内贮藏，但用尼龙丝网袋装马铃薯堆放效果更好，既便于贮藏期管理，又可以减轻贮藏期的损失。对将要入库的马铃薯，先晾晒，使其在库(窖)外度过后熟期，然后装袋码垛，每袋50千克，垛不要太高，一般码5袋高，两列并排为一行，行的长度视库的大小来定。行与行之间要留半米左右的通风道，以利于通风。并用木杠将袋子与地面隔开，以利于地热及土地湿气的散失。贮藏量不宜超过全库容积的2／3，最好在l／2～3／5。不耐藏，易发芽的品种堆高不得超过1米，耐贮藏、休眠期中等的品种堆高不得超过2米。耐贮藏、休眠期长的品种堆高不得超过3米。
(4)控制库(窖)内温度
库内温度过低，块茎会受冻；库内温度过高，会使薯堆伤热，导致烂薯。一般情况下，当库温度在-3～-l℃时，9个小时块茎就冻硬；-5℃时2个小时块茎就受冻。长朋在0℃左右环境中贮藏块茎，芽的生长和萌发受到抑制，生命力减弱。高温下贮藏，块茎打破休眠的时间较短，也易引起烂薯。最适宜的贮存温度是：商品薯4～5℃，种薯l～3℃，加工用的薯块以7～8℃为宜。高于标准温度上限就要打开库门散热。当贮藏期间温度降低时，在薯堆上盖一层稻草或草帘子，既能保温防冻，又能吸收堆内放出的潮气。
(5)控制库(窖)内湿度
库内过于干燥，极易导致薯块失水皱缩，降低块茎的商品性和种用性；库内过于潮湿，块茎上会凝结小水滴，也就是通常所说的“出汗”现象，并且会导致烂薯。因此，贮藏适宜的空气湿度是薯堆表面既无“出汗”现象，又能保持薯皮新鲜。如果发生“出汗”，说明环境过于潮湿，应及时倒堆，通风散湿；如果薯块皱缩，说明窖内湿度过小，应设法增大空气湿度，但不能直接向薯块上喷水，湿度一般控制在80％～90％为宜。必要时可以在马铃薯堆上面盖一层草帘子，这样不仅能防寒保湿，还可以挡住顶水滴落在马铃薯上造成腐烂。
(6)通风换气
窖内必须有流通的清洁空气，以保证块茎正常呼吸。应该在库(窖)内安装通风换气设备。通风换气可防止块茎黑心，还可降低窖温。
(7)倒窖和防病
如果窖温或堆温过高，可以倒堆散热。当发现堆温升高到8℃以上，并查明是因病薯腐烂发热时，应立即倒窖，淘汰掉病薯，并可散热防止发芽。